Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms