Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms