Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD35Q8N283 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms