Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms