Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM72Q6ZMU5 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms