Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms