Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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