Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNS3Q68CZ2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms