Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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LINC01545Q5VT33 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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LINC01545Q5VT33 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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LINC01545Q5VT33 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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LINC01545Q5VT33 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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LINC01545Q5VT33 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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LINC01545Q5VT33 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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LINC01545Q5VT33 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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LINC01545Q5VT33 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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LINC01545Q5VT33 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC01545Q5VT33 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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