Protein–RNA interactions for Protein: Q52LG2

KRTAP13-2, Keratin-associated protein 13-2, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-2Q52LG2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-2Q52LG2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms