Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms