Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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