Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms