Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSNAXIP1Q2TAA8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms