Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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COL24A1Q17RW2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL24A1Q17RW2 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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