Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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