Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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