Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PCK2Q16822 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCK2Q16822 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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