Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms