Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
USF2Q15853 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
USF2Q15853 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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