Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SS18Q15532 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms