Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEC23BQ15437 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEC23BQ15437 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms