Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NCF4Q15080 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms