Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
R3HDM1Q15032 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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