Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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