Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms