Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NWD1Q149M9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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