Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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GBX1Q14549 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GBX1Q14549 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GBX1Q14549 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GBX1Q14549 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GBX1Q14549 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GBX1Q14549 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GBX1Q14549 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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GBX1Q14549 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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