Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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TRIM25Q14258 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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TRIM25Q14258 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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TRIM25Q14258 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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TRIM25Q14258 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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