Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CKAP5Q14008 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms