Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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