Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LAMC2Q13753 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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