Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMB3Q13751 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms