Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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