Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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