Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 DEFT1P-201ENST00000453425 496 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 TUBD1-206ENST00000539018 1027 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CAMK2BQ13554 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms