Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PPP1R1AQ13522 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms