Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB3Q13509 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB3Q13509 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB3Q13509 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB3Q13509 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms