Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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