Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms