Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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