Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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SRSF5Q13243 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SRSF5Q13243 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SRSF5Q13243 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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