Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RPA4Q13156 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RPA4Q13156 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RPA4Q13156 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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