Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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