Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms