Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXO1Q12778 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXO1Q12778 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXO1Q12778 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXO1Q12778 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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