Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms