Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms