Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LRP1Q07954 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms