Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms